Züchtungskunde, 83, (1) S. 27-33, 2011, ISSN 0044-5401
© Verlag Eugen Ulmer, Stuttgart
Scientific Articles
Gestaltung der Zukunft von Genomik in der Tierzucht
A. Eggen1 ; 1 Illumina, Inc., San Diego, USA, E-Mail: aeggen@illumina.com
Die Entwicklung der genomischen Technologien in den letzten Jahren haben Gesamtgenom-Sequenzierungsprojekte ermöglicht: dadurch ist die Menge der verfügbaren Daten für Nutztiergenome stark gestiegen. Diese Daten sind nicht nur nützlich für die Bestimmung von genomischen Strukturen und Funktionen, sondern auch (gemeinsam mit neuen DNA-Analysetechnologien) für die bessere und schnellere Charakterisierung der verschiedenen Varianten in Nutztierpopulationen. Dies bringt drastische Veränderungen bei den Nutztierwissenschaften und der Tierzucht mit sich: quantitative Merkmale können jetzt durch Kopplungsungleichgewichtsanalyse feinkartiert und Züchtungsentscheidungen mit Hilfe genomischer Informationen getroffen werden. Zusammen mit den beträchtlichen phänotypischen Informationen wird es dann in ein kosteneffektiveres Auswahlschema integriert. Während die Genomik-Ära die Vorhersage der Konsequenzen aus der DNA-Sequenz einzelner Individuen ermöglichen sollte, bestehen neue Herausforderungen wie ein besseres Verständnis der Funktion eines Genoms und eine bessere Beschreibung des Beitrags epigenetischer Mechanismen, die zur phänotypischen Variabilität von Merkmalen führen.
Genomik; Tierzucht; SNP; Beadchip; Gesamtgenomsequenzierung
Shaping the future of Animal AgriGenomics
Over the past years and thanks to the development of high throughput genomic tools, whole genome sequencing efforts have enabled a rapid increase in the amount of data available on the genome of livestock species. In addition to their usefulness to better describe genomic structures and functions, new technologies, such as high-quality solutions for interrogating genetic variation in livestock populations, are in fact revolutionizing animal research and breeding: quantitative trait loci can now be mapped in genome wide scans by exploiting Linkage Disequilibrium (LD) and selection decisions will now be based on genomic information, associated with considerable phenotypic information, offering a more cost-effective selection schema. However, while the genomics era should enable the prediction of consequences based on the full DNA sequence of many individuals, new challenges are now to better describe the exact functioning of a genome and better evaluate the contribution of epigenetics to the phenotypic variability of traits of economic interest as it may provide a dynamic and relevant view of possibilities for adaptation to environmental changes.
Genomics; Animal Breeding; SNP; Beadchip; Whole Genome Sequencing