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Monitoring of genetic diversity in livestock: Results for the population Rotes Höhenvieh

Summary

Base parameters characterizing the genetic diversity of the endangered breed Rotes Höhenvieh (RHV) were estimated as a starting point for regular monitoring. Using the POPREP web-system the generation interval, family size, pedigree completeness index (PCI), inbreeding coefficient, rate of inbreeding and the effective population size N_e were calculated. Five pedigree-based methods for the calculation of the N_e were investigated and compared. For this breed, the PCI was problematically low (open herdbook) resulting in some of the calculated rates of inbreeding hardly to be explained. The N_e-values fluctuated depending on the definition of the side conditions. The N_e classifies the RHV in the conservation category according to the National Programme for Animal Genetic Resources.

german version

Keywords/Stichworte:Genetic diversity; Rotes Höhenvieh; inbreeding; effective population size; pedigree; monitoring

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