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Feinkartierung von QTL für Fleischqualitätsmerkmale auf dem porcinen Chromosom 1 (Masterarbeit)

Christine Große-Brinkhaus, C. Phatsara, E. Tholen, K. Schellander und Elisabeth Jonas
Institut für Tierwissenschaften, Abteilung Tierzucht, Tierhaltung und Haustiergenetik, Rheinische- Friedrich-Wilhelms Universität Bonn, Endenicher Allee 15, 53115 Bonn, E-Mail: cgro@itw.uni-bonn.de

Ziel dieser Arbeit war es, die Region für die von Liu et al. (2007) detektierten QTL für den Merkmalskomplex pH-Wert nach der Schlachtung weiter einzugrenzen. Dazu wurde eine feinere Kartierung auf dem porcinen Chromosom 1 in einer Duroc × Pietrain Ressourcen- Population durchgeführt. Für die Analyse wurden zu den zwölf bereits analysierten Markern sechs zusätzliche Mikrosatelliten für die spezifische Region auf dem Chromosom auf Grundlage der Onlinedatenbank USDA-Marc ausgewählt. Zur Vergleichbarkeit der Ergebnisse wurden die Berechnungen analog zu der Studie von Liu et al. (2007) durchgeführt. Dazu wurden mit dem Softwarepaket SAS (Version 9.1) die phänotypischen Einflussfaktoren ermittelt, mit CriMap die Kopplungskarten erstellt und mit QTL-Express die QTL für die Merkmale pH-Wert 45 min und 24 h nach Schlachtung im Kotelett sowie 24 h nach der Schlachtung im Schinken berechnet. Die geschlechtsneutrale Kopplungskarte war 203,2 cM lang. Die Ergebnisse von Liu et al. (2007) konnten im Rahmen dieser Arbeit konkretisiert werden; die Regionen wurden um etwa ein Drittel eingegrenzt. Auf Grund von Analogien zwischen Mensch und Schwein konnten verschiedene positionelle und funktionelle Kandidatengene in den QTL Regionen identifiziert werden.

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Keywords/Stichworte:Schweine, Fleischqualität, pH-Wert, Quantitative Trait Loci, Kandidatengen, Feinkartierung

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