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Entwicklung von genetischen Markern zur Infektabwehr und Resistenz im Atemtrakt des Schweins (IRAS) – Aktueller Stand des FUGATO Projekts IRAS

B. Tümmler, G. Gerlach und das FUGATO-Konsortium IRAS
Klinische Forschergruppe, OE 6710, Medizinische Hochschule Hannover, Carl-Neuberg-Str. 1, 30625 Hannover, E-Mail: tuemmler.burkhard@mh-hannover.de, Institut für Mikrobiologie, Zentrum für Infektionsmedizin, Stiftung Tierärztliche Hochschule Hannover, Bischofsholer Damm 15, 30173 Hannover, E-Mail: gfgerlach@gmx.de

Atemwegserkrankungen stellen ein erhebliches wirtschaftliches Problem in der Schweineproduktion dar. Die Konsortien IRAS und RePoRI wollen genetische Marker für die Suszeptibilität und Resistenz des Schweins zur Atemwegsinfektion entwickeln. Schweine aus den Zuchtlinien Pietrain, Hampshire, Deutsche Landrasse, Deutsches Edelschwein wurden in einem standardisierten Atemwegsinfektionsmodell mit Actinobacillus pleuropneumoniae infiziert. Der Verlauf der Infektion wurde anhand klinischer Symptome, Ultraschall- und Röntgenuntersuchungen, immunologischer Parameter, Sektion, Transkriptom des Lungengewebes und Glykoproteom der bronchoalveolären Lavageflüssigkeit dokumentiert. Dabei wurden deutliche Rasseunterschiede im Krankheitsverlauf beobachtet. Klinik, Immunologie und genomweite Expressionsanalysen zeigten übereinstimmend, dass das angeborene Immunsystem die Schwere der Atemwegsinfektion mit A. pleuropneumoniae bestimmt. In einer Assoziationsstudie an phänotypisch kontrastierenden nicht–überlappenden Kernfamilien mit leichtem bzw. schwerem Verlauf der Infektion der F1-Tiere wird nach genetischen Modulatoren gesucht. Das Kandidatengen wird initial anhand der Allelverteilung eines intragenischen Mikrosatelliten in den phänotypisch kontrastierenden Gruppen daraufhin geprüft, ob der Locus einen genetischen Modulator enthält. Falls ja, werden alle SNPs im Locus ermittelt und anhand der Verteilung von Markerhaplotypen in den Gruppen die phänotyprelevanten SNPs identifiziert. Bis September 2008 wurden informative Mikrosatelliten für 42 Kandidatengene der ‚innate immunity‘ etabliert und mehrere phänotypische und genetische Marker für die Suszeptibilität zur Infektion mit A. pleuropneumoniae entdeckt.

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Keywords/Stichworte:Actinobacillus pleuropneumoniae , Assoziationsstudie, genetischer Modulator, Pneumonie, Proteom, Schwein, Transkriptom

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